Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slfn8B1ARD8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slfn8B1ARD8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn8B1ARD8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms