Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprsB0V2N1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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PtprsB0V2N1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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PtprsB0V2N1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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PtprsB0V2N1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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PtprsB0V2N1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprsB0V2N1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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PtprsB0V2N1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PtprsB0V2N1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PtprsB0V2N1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PtprsB0V2N1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PtprsB0V2N1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PtprsB0V2N1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PtprsB0V2N1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PtprsB0V2N1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PtprsB0V2N1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PtprsB0V2N1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PtprsB0V2N1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms