Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms