Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms