Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ambra1A2AH22 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms