Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm16A2A935 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
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