Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm2A2A7B5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms