Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo47A2A6H3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo47A2A6H3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms