Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cul4bA2A432 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cul4bA2A432 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms