Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms