Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms