Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A0A0U1RNP2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A0A0U1RNP2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms