Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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