Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms