Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc26a4Q9R155 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc26a4Q9R155 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc26a4Q9R155 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc26a4Q9R155 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc26a4Q9R155 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc26a4Q9R155 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slc26a4Q9R155 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slc26a4Q9R155 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slc26a4Q9R155 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slc26a4Q9R155 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Slc26a4Q9R155 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slc26a4Q9R155 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slc26a4Q9R155 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Slc26a4Q9R155 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Slc26a4Q9R155 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Slc26a4Q9R155 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slc26a4Q9R155 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc26a4Q9R155 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc26a4Q9R155 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc26a4Q9R155 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc26a4Q9R155 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc26a4Q9R155 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slc26a4Q9R155 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slc26a4Q9R155 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slc26a4Q9R155 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slc26a4Q9R155 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc26a4Q9R155 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc26a4Q9R155 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc26a4Q9R155 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc26a4Q9R155 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc26a4Q9R155 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc26a4Q9R155 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc26a4Q9R155 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc26a4Q9R155 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc26a4Q9R155 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc26a4Q9R155 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc26a4Q9R155 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc26a4Q9R155 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc26a4Q9R155 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc26a4Q9R155 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc26a4Q9R155 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc26a4Q9R155 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc26a4Q9R155 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc26a4Q9R155 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc26a4Q9R155 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc26a4Q9R155 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc26a4Q9R155 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc26a4Q9R155 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc26a4Q9R155 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc26a4Q9R155 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc26a4Q9R155 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc26a4Q9R155 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc26a4Q9R155 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc26a4Q9R155 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc26a4Q9R155 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc26a4Q9R155 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc26a4Q9R155 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Slc26a4Q9R155 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc26a4Q9R155 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc26a4Q9R155 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc26a4Q9R155 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc26a4Q9R155 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc26a4Q9R155 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc26a4Q9R155 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slc26a4Q9R155 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slc26a4Q9R155 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slc26a4Q9R155 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slc26a4Q9R155 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc26a4Q9R155 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc26a4Q9R155 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc26a4Q9R155 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc26a4Q9R155 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc26a4Q9R155 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc26a4Q9R155 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc26a4Q9R155 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Slc26a4Q9R155 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc26a4Q9R155 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc26a4Q9R155 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc26a4Q9R155 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc26a4Q9R155 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc26a4Q9R155 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc26a4Q9R155 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc26a4Q9R155 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc26a4Q9R155 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc26a4Q9R155 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc26a4Q9R155 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc26a4Q9R155 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc26a4Q9R155 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Slc26a4Q9R155 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc26a4Q9R155 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc26a4Q9R155 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc26a4Q9R155 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc26a4Q9R155 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc26a4Q9R155 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc26a4Q9R155 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc26a4Q9R155 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc26a4Q9R155 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc26a4Q9R155 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc26a4Q9R155 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms