Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
4930550L24RikQ99PA7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930550L24RikQ99PA7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930550L24RikQ99PA7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930550L24RikQ99PA7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930550L24RikQ99PA7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930550L24RikQ99PA7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930550L24RikQ99PA7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930550L24RikQ99PA7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930550L24RikQ99PA7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930550L24RikQ99PA7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930550L24RikQ99PA7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930550L24RikQ99PA7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930550L24RikQ99PA7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930550L24RikQ99PA7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930550L24RikQ99PA7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930550L24RikQ99PA7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930550L24RikQ99PA7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930550L24RikQ99PA7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms