Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-M2Q6W9L1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.33■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M2Q6W9L1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M2Q6W9L1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M2Q6W9L1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M2Q6W9L1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M2Q6W9L1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M2Q6W9L1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M2Q6W9L1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M2Q6W9L1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M2Q6W9L1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M2Q6W9L1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M2Q6W9L1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M2Q6W9L1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M2Q6W9L1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M2Q6W9L1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M2Q6W9L1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M2Q6W9L1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M2Q6W9L1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-M2Q6W9L1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M2Q6W9L1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M2Q6W9L1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-M2Q6W9L1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-M2Q6W9L1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M2Q6W9L1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M2Q6W9L1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M2Q6W9L1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-M2Q6W9L1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-M2Q6W9L1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M2Q6W9L1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M2Q6W9L1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M2Q6W9L1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-M2Q6W9L1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-M2Q6W9L1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-M2Q6W9L1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms