Protein–RNA interactions for Protein: P55288

Cdh11, Cadherin-11, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh11P55288 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh11P55288 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdh11P55288 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdh11P55288 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdh11P55288 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdh11P55288 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh11P55288 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh11P55288 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh11P55288 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh11P55288 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdh11P55288 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdh11P55288 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh11P55288 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh11P55288 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh11P55288 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh11P55288 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh11P55288 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdh11P55288 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdh11P55288 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh11P55288 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh11P55288 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh11P55288 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh11P55288 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh11P55288 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms