Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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Rabgef1Q9JM13 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Rabgef1Q9JM13 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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Rabgef1Q9JM13 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Rabgef1Q9JM13 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Rabgef1Q9JM13 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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Rabgef1Q9JM13 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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