Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp29Q9ES63 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms