Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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Swt1Q9DBQ9 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Swt1Q9DBQ9 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Swt1Q9DBQ9 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Swt1Q9DBQ9 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Swt1Q9DBQ9 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Swt1Q9DBQ9 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Swt1Q9DBQ9 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Swt1Q9DBQ9 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Swt1Q9DBQ9 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Swt1Q9DBQ9 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Swt1Q9DBQ9 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Swt1Q9DBQ9 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Swt1Q9DBQ9 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Swt1Q9DBQ9 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Swt1Q9DBQ9 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Swt1Q9DBQ9 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Swt1Q9DBQ9 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Swt1Q9DBQ9 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Swt1Q9DBQ9 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Swt1Q9DBQ9 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms