Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Capns2Q9D7J7 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Capns2Q9D7J7 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Capns2Q9D7J7 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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