Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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