Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms