Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Use1Q9CQ56 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Use1Q9CQ56 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Use1Q9CQ56 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Use1Q9CQ56 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Use1Q9CQ56 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Use1Q9CQ56 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Use1Q9CQ56 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms