Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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Atg4dQ8BGV9 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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Atg4dQ8BGV9 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Atg4dQ8BGV9 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Atg4dQ8BGV9 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Atg4dQ8BGV9 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Atg4dQ8BGV9 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Atg4dQ8BGV9 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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Atg4dQ8BGV9 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Atg4dQ8BGV9 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Atg4dQ8BGV9 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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