Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NischQ80TM9 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NischQ80TM9 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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