Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NipblQ6KCD5 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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