Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms