Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.2 ms