Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Trim71Q1PSW8 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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