Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Usp46P62069 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Usp46P62069 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Usp46P62069 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Usp46P62069 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms