Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
VdrP48281 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.5 ms