Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Nedd1P33215 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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Nedd1P33215 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Nedd1P33215 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Nedd1P33215 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms