Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprmP28828 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Plec-205ENSMUST00000073418 15455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprmP28828 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PtprmP28828 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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