Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PdgfraP26618 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PdgfraP26618 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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