Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms