Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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Spocd1B1ASB6 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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