Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms