Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CtcflA2APF3 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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