Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms