Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp29Q9ES63 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms