Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Rnft1Q9DCN7 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rnft1Q9DCN7 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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