Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rprd1bQ9CSU0 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.9 ms