Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Hps4Q99KG7 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Hps4Q99KG7 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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Hps4Q99KG7 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Hps4Q99KG7 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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Hps4Q99KG7 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hps4Q99KG7 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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