Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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Ddb2Q99J79 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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Ddb2Q99J79 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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Ddb2Q99J79 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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Ddb2Q99J79 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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Ddb2Q99J79 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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Ddb2Q99J79 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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Ddb2Q99J79 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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Ddb2Q99J79 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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Ddb2Q99J79 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ddb2Q99J79 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms