Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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Atg4aQ8C9S8 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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Atg4aQ8C9S8 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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Atg4aQ8C9S8 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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Atg4aQ8C9S8 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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Atg4aQ8C9S8 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Atg4aQ8C9S8 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Atg4aQ8C9S8 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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Atg4aQ8C9S8 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Atg4aQ8C9S8 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Atg4aQ8C9S8 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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