Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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