Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Gm28047Q3US59 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Gm28047Q3US59 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms