Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 290.2 ms